本书主要介绍基于GraphPad Prism 9 的学术图表绘制方法。本书以软件所定义的8 种数据表为纲，按照“数据录入—数据分析—图表生成与美化”的顺序，结合科研实例，使用t 检验、方差分析、生存分析和主成分分析等相关统计分析方法，介绍了散点图、气泡图、柱状图、线图、饼图、面积图等常见学术图表的绘制和美化方法。同时本书提炼了学术图表绘制的一般流程、配色方法及GraphPad Prism 绘图的进阶技巧，兼顾学术图表绘制的实用性和美观性，适用于需要绘制学术图表的高校学生和科研人员。
张敏，生物学博士，公众号“如图所示”主创。拥有多年科研绘图经验，录制有《PPT科研作图》、《零基础玩转illustrator科研绘图》、《photoshop科研位图全攻略》和《实用SCI论文图表绘制》等网络课程，翻译有Adobe官方教程《adobe illustrator CC2019经典教程》。
第1 章 GraphPad Prism 快速入门 1
1.1 GraphPad Prism 简介 1
1.2 GraphPad Prism 下载和安装 2
1.3 GraphPad Prism 使用界面介绍 3
1.3.1 欢迎界面 3
1.3.2 操作界面 6
1.4 GraphPad Prism 图形修饰和美化 17
1.4.1 图形绘制区的修饰和美化 18
1.4.2 坐标轴区的修饰和美化 23
1.5 学术图表配色知识 . 29
1.5.1 色彩三要素 30
1.5.2 色轮和色轮配色方法 32
1.5.3 色轮配色工具 36
1.6 GraphPad Prism 图片导出和发送 41
1.6.1 图片导出 41
1.6.2 图片发送 43
1.7 GraphPad Prism 一般操作流程 44
第2 章 GraphPad Prism 图表与常见统计方法选择 45
2.1 图表分类及选择 . 45
2.1.1 按照图表外观分类 45
2.1.2 按照图表展示的数据关系分类 47
2.1.3 GraphPad Prism 自定义的8 种数据表 . 48
2.2 常见统计分析方法 . 51
第3 章 XY 表及其图形绘制 . 60
3.1 XY 表及其输入界面 . 60
3.1.1 XY 表输入界面 60
3.1.2 XY 表统计分析方法 63
3.1.3 XY 表下可绘制图形 64
3.2 XY 表常见图形绘制 . 65
3.2.1 散点图 65
3.2.2 象限散点图 71
3.2.3 火山图 74
3.2.4 克利夫兰点图、棒棒糖图 84
3.2.5 模拟直方图 86
3.2.6 线条连接的散点图 88
3.2.7 双Y 轴图形 95
3.2.8 折线图和曲线图 100
3.2.9 图形平移：瀑布图 104
3.2.10 坐标轴平移和波动中心轴设置 106
3.2.11 非连续X 值绘图 109
3.2.12 面积图 110
3.3 带统计分析的XY 表图形绘制 114
3.3.1 相关分析 115
3.3.2 简单线性回归 118
3.3.3 非线性回归 123
3.3.4 带置信条带的散点图 132
第4 章 纵列表（Column）及其图形绘制 . 135
4.1 纵列表及其输入界面 . 135
4.1.1 纵列表输入界面 135
4.1.2 纵列表统计分析方法 137
4.1.3 纵列表下可绘制图形 137
4.2 纵列表常见图形绘制 . 141
4.2.1 简单柱状图/条形图 . 141
4.2.2 截断柱状图 147
4.2.3 直方图 150
4.2.4 手动分组分割 153
4.2.5 悬浮条形图 155
4.2.6 森林图 157
4.3 带统计分析的纵列表图形绘制 . 163
4.3.1 单样本t 检验 . 163
4.3.2 成组t 检验——单数据系列柱状图 . 164
4.3.3 配对t 检验 . 171
4.3.4 普通单因素方差分析 174
4.3.5 随机区组设计单因素方差分析 182
4.3.6 重复测量单因素方差分析 187
4.3.7 ROC 曲线绘制 . 190
4.3.8 Bland-Altman 图 . 196
第5 章 行列分组表（Grouped）及其图形绘制 . 200
5.1 行列分组表及其输入界面 . 200
5.1.1 行列分组表输入界面 200
5.1.2 行列分组表统计分析方法 201
5.1.3 行列分组表下可绘制图形 202
5.2 行列分组表常见图形绘制 . 205
5.2.1 交错和分隔柱状图 205
5.2.2 堆积柱状图 211
5.2.3 双向柱状图 216
5.2.4 叠印柱状图 221
5.2.5 热图 224
5.3 带统计分析的行列分组表图形绘制 . 231
5.3.1 二因素方差分析 231
5.3.2 三因素方差分析 237
第6 章 列联表（Contingency）及其图形绘制 . 238
6.1 列联表及其输入界面 . 238
6.2 带统计分析的列联表图形绘制 . 239
第7 章 生存表（Survival）及生存曲线绘制 . 244
7.1 生存曲线和生存表简介 . 244
7.2 传统K-M 生存曲线绘制 247
7.3 基因表达K-M 生存曲线绘制 251
第8 章 其他数据表及其图形绘制 . 256
8.1 局部整体表（Parts of whole）及其图形绘制 256
8.2 多变量表（Multiple variables）及其图形绘制 260
8.2.1 气泡图绘制 262
8.2.2 主成分分析 265
8.3 嵌套表（Nested）及其图形绘制 270
第9 章 GraphPad Prism 绘图进阶技巧 275
9.1 首选项设置 . 275
9.2 图形组合 . 278
9.2.1 图中图 278
9.2.2 图形堆叠：带箱线图的前后图等 281
9.2.3 图形拼接：边际图 285
9.3 自定义配色方案 . 291
9.4 风格一致快速绘图：魔棒工具和克隆 . 296
9.4.1 魔棒工具 296
9.4.2 克隆和模板 300
参考文献 . 304
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