本书主要介绍了国内外水环境领域前沿的微生物群落结构解析的实验方法,包括水环境样品(淡水和沉积物)DNA提取方法、变形梯度凝胶电泳(DGGE)技术、末端限制性片段长度多态性(T—RFLP)技术、脉冲场电泳技术(PFGE)、Biolog微生物群落生理学(CLPP)技术、MIDI脂肪酸(FAA)技术等内容。
李冬梅,哈尔滨工业大学环境学院高级工程师。主持、参与并完成国家自然基金和国家重大专项5项;获哈尔滨工业大学教学成果奖1项;获国家发明专利6项;近年来发表SCI文章10余篇,出版教材1部。研究方向:环境微生物、生物质能。
第1章 样品核酸的提取
1.1 淡水微生物DNA的提取
1.2 水中沉积物微生物DNA的提取
1.3 提取DNA的纯化
1.4 小结
参考文献
第2章 变性梯度凝胶电泳(DGGE)
2.1 变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术简介
2.2 DGGE操作过程
2.3 PCR-DGGE分析真菌群落
参考文献
第3章 微生物群落的末端限制性片段长度多态性分析(T-RFLP)
3.1 实验过程
3.2 微生物种群的比较分析
3.3 操作步骤
3.4 实验说明
参考文献
第4章 脉冲场凝胶电泳(PFGE)
4.1 PFGE的原理
4.2 影响PFGE分辨率的因素
4.3 基因分型原理
4.4 PulseNet相关知识
4.5 PFGE基因分型技术的应用
参考文献
第5章 微生物代谢的Biolog微平板法
5.1 BiologGENIII(GN/GP)微生物鉴定板
5.2 BiologAN微生物鉴定板
5.3 BiologFF微生物鉴定板
5.4 BiologYT微生物鉴定板
5.5 BiologEco微生物鉴定板
参考文献
第6章 微生物分类学和生态学中的脂肪酸分析
6.1 纯培养微生物的鉴定
6.2 磷脂脂肪酸图谱法(PLFA)测定微生物群落结构
参考文献